남북한 교류 및 화합과 남북바카라의 효율적 운영을 위하여 1971년 9월에 설립되었다.
남북적십자바카라사무국으로 출발하여 1973년 남북조절위사무국과 통합되었다가 1980년 남북대화사무국으로, 1992년 다시 남북바카라사무국으로 개칭하여 1997년 현재에 이르고 있다. 통일부장관의 명을 받아 소관사무를 통할하고 소속공무원을 지휘·감독한다.
1997년 현재 국장 밑에 바카라운영부와 바카라연락부 등 2개 부가 있으며, 바카라운영부는 다시 기획과·바카라1과·바카라2과로, 바카라연락부는 연락과·관리과로 나누어져 2부 5과로 운영되고 있다.
바카라운영부의 기획과는 남북바카라에 관한 협상대책의 수립, 각종 남북한 접촉지침의 작성, 남북바카라대책 수립에 관한 국내외 학술·연구 기관과의 협조, 남북한 참가 국제바카라 및 국제행사에서의 남북바카라관련 전략지원, 남북바카라자문기구의 운영, 남북한 바카라전략의 비교·분석, 남북바카라에 관한 정보의 분석 및 처리, 남북바카라에 관한 국내외 반응의 분석 및 처리, 기타 남북바카라전략분석에 관한 사항을 담당한다.
바카라운영부의 바카라 1과는 남북정치 분야에 관한 바카라운영계획의 수립, 남북정치 분야에 관한 바카라의 진행 및 상황처리, 남북정치 분야에 관한 바카라대표단의 운영·지원, 남북정치 분야바카라에 관한 유관기관과의 협조, 남북정치 분야바카라에 관한 자료의 생산 및 보존관리, 남북군사 분야에 관한 바카라운영계획의 수립, 남북군사 분야에 관한 바카라의 진행 및 상황처리, 남북군사 분야에 관한 바카라대표단의 운영·지원, 남북군사 분야바카라에 관한 유관기관과의 협조, 남북군사 분야바카라에 관한 자료의 생산 및 보존관리를 한다.
바카라운영부의 바카라 2과는 남북의 교육·문학·예술·보건·체육·출판·언론 등 사회문화 분야에 관한 바카라운영계획의 수립, 남북의 교육·문학·예술·보건·체육·출판·언론 등 사회문화 분야에 관한 바카라의 진행 및 상황처리, 남북의 교육·문학·예술·보건·체육·출판·언론 등 사회문화 분야에 관한 바카라대표단의 운영·지원, 남북의 교육·문학·예술·보건·체육·출판·언론 등 사회문화 분야바카라에 관한 유관기관과의 협조, 남북의 교육·문학·예술·보건·체육·출판·언론 등 사회문화 분야바카라에 관한 자료의 생산 및 보존관리업무를 담당한다.
또한 남북의 경제·과학·기술·환경·수송·통신 등 경제 분야에 관한 바카라운영계획의 수립, 남북의 경제·과학·기술·환경·수송·통신 등 경제 분야에 관한 바카라의 진행 및 상황처리, 남북의 경제·과학·기술·환경·수송·통신 등 경제 분야에 관한 바카라대표단의 운영·지원, 남북의 경제·과학·기술·환경·수송·통신 등 경제 분야바카라에 관한 유관기관과의 협조, 남북의 경제·과학·기술·환경·수송·통신 등 경제 분야에 관한 자료의 생산 및 보존관리를 한다.
그리고 바카라연락부의 연락과와 관리과 두 과는 연락관 파견 및 남북연락에 관한 사항, 판문점 지역 내의 바카라행사지원, 판문점 지역의 출입·보안 및 통제, 판문점 지역 내의 동향수집, 판문점 지역 내의 시설 및 장비의 관리, 기타 남북바카라 연락에 관한 사항, 남북간 통신협조와 통신망의 관리·운용 등을 수행하고 있다.
1970년대 7차례에 걸친 남북적십자 본바카라, 두 차례의 남북조절위원회 회의, 남한측 조절위와 북한측 조국전선 간의 대표접촉 3회, 남북탁구협회 회의 4회를 성사시켰고, 1980년대에는 남북총리바카라 실무대표 접촉, 남북체육바카라·4차 스위스 로잔 체육바카라·남북적십자바카라·남북경제바카라·남북국회바카라 예비 및 준비접촉을 이끌어 냈다.
1990년대에는 제8차 남북고위급바카라 및 분과위원회 회의, 남북체육바카라, 남북적십자 실무대표 접촉, 남북 특사교환을 위한 실무대표접촉, 남북정상바카라을 위한 준비접촉, 남북간 베이징[北京]바카라, 4자 예비바카라 및 6차의 본바카라, 대북 구호물자 전달을 위한 남북적십자대표 접촉, 남북 당국 대표바카라, 남북차관급 당국 바카라 등을 성공적으로 수행하였던 것이다.
그리고 판문점 내 남북바카라 연락기구에는 남북연락사무소, 남북적십자바카라 연락사무소, 남북바카라사무국 전방사무소, 남북직통전화 등이 있다. 1998년 현재 사무국의 위치는 서울특별시 종로구 와룡동 산 3·25번지에 있다.